Hierarchy For All Packages

Package Hierarchies:

• edu.claflin.finder,
• edu.claflin.finder.algo,
• edu.claflin.finder.algo.clustering,
• edu.claflin.finder.algo.clustering.struct,
• edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.fast_greedy_struct,
• edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.girvan_newman_struct,
• edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.infomap_struct,
• edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.leading_eigenvector_struct,
• edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.louvain_struct,
• edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.walk_trap_struct,
• edu.claflin.finder.algo.huffman,
• edu.claflin.finder.algo.shortestpath,
• edu.claflin.finder.algo.spanningtree,
• edu.claflin.finder.io,
• edu.claflin.finder.io.graph,
• edu.claflin.finder.io.graph.sub,
• edu.claflin.finder.log,
• edu.claflin.finder.logic,
• edu.claflin.finder.logic.comp,
• edu.claflin.finder.logic.cond,
• edu.claflin.finder.logic.cygrouper,
• edu.claflin.finder.logic.processor,
• edu.claflin.finder.struct

Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • java.util.AbstractCollection<E> (implements java.util.Collection<E>)
    • java.util.AbstractQueue<E> (implements java.util.Queue<E>)
      • java.util.PriorityQueue<E> (implements java.io.Serializable)
        • edu.claflin.finder.struct.PrioritySet<T>
    • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.girvan_newman_struct.MapBinaryHeap<T> (implements java.util.Queue<E>)
  • edu.claflin.finder.algo.Algorithm (implements edu.claflin.finder.logic.processor.Processable<T,S>)
    • edu.claflin.finder.algo.BreadthFirstTraversalSearch
    • edu.claflin.finder.algo.BronKerbosch
    • edu.claflin.finder.algo.Bundle (implements java.beans.PropertyChangeListener)
    • edu.claflin.finder.algo.clustering.ClusteringAlgorithm
      • edu.claflin.finder.algo.clustering.FastGreedy
      • edu.claflin.finder.algo.clustering.GirvanNewman
      • edu.claflin.finder.algo.clustering.Infomap
      • edu.claflin.finder.algo.clustering.LabelPropagation
      • edu.claflin.finder.algo.clustering.LeadingEigenvector
      • edu.claflin.finder.algo.clustering.Louvain
      • edu.claflin.finder.algo.clustering.Walktrap
    • edu.claflin.finder.algo.ConnectedComponentsDFS
    • edu.claflin.finder.algo.DepthFirstTraversalSearch
    • edu.claflin.finder.algo.shortestpath.DijkstraShortestPath
    • edu.claflin.finder.algo.spanningtree.ExtremumSpanningTree
      • edu.claflin.finder.algo.spanningtree.Kruskal
      • edu.claflin.finder.algo.spanningtree.Prim
    • edu.claflin.finder.algo.MatrixPatternAnalyzer
    • edu.claflin.finder.algo.shortestpath.ShortestPath
  • edu.claflin.finder.algo.ArgumentsBundle
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.infomap_struct.AvgBitLength
  • edu.claflin.finder.logic.processor.BatchProcessor<T,S>
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.girvan_newman_struct.BetweennessCentrality
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.girvan_newman_struct.BetweennessCentrality.BetweennessComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.girvan_newman_struct.BetweennessCentrality.BetweennessData
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.BinarySearchTree<T>
  • edu.claflin.finder.BronKersbochDriver
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.Communicator (implements edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CommunicationListener)
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.Communities
  • edu.claflin.finder.ComponentsDriver
  • edu.claflin.finder.logic.Condition
    • edu.claflin.finder.logic.cond.BipartiteCondition
    • edu.claflin.finder.logic.cond.CliqueCondition
    • edu.claflin.finder.logic.cond.DirectedCliqueCondition
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CygrouperAssembler
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CygrouperEdge
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CygrouperNode
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CytogrouperMain
  • edu.claflin.finder.struct.DisjointSet<T>
  • edu.claflin.finder.logic.Edge
  • edu.claflin.finder.EdgeBetweennessDriver
  • edu.claflin.finder.logic.comp.EdgeWeightComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.leading_eigenvector_struct.EigenvalueDecomposition (implements java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.FastGreedyDriver
  • edu.claflin.finder.FinderDriver
  • edu.claflin.finder.Global
  • edu.claflin.finder.logic.Graph
    • edu.claflin.finder.logic.ConditionedGraph
  • edu.claflin.finder.logic.comp.GraphAverageWeightComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.logic.comp.GraphSizeComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.fast_greedy_struct.HeapNodeFG (implements java.lang.Comparable<T>)
    • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.fast_greedy_struct.IndexedHeapNode
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.walk_trap_struct.HeapNodeWT (implements java.lang.Comparable<T>)
  • edu.claflin.finder.logic.comp.HuffComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.algo.huffman.HuffmanCode
  • edu.claflin.finder.algo.huffman.HuffmanNode
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.fast_greedy_struct.IndexedHeapQueue
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.infomap_struct.InfomapAlgorithm
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.infomap_struct.InfomapImplementation
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.infomap_struct.InfomapTester
  • edu.claflin.finder.LabelPropDriver
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.leading_eigenvector_struct.LeadingEigenvectorAlgorithm
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.leading_eigenvector_struct.LeadingEigenvectorAlgorithm.MappedModularityMatrix
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.leading_eigenvector_struct.LeadingEigenvectorAlgorithm.SwapInfo
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.leading_eigenvector_struct.LeadingEigenvectorAlgorithm.VectorInfo
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.leading_eigenvector_struct.LeadingEigenvectorCaller
  • edu.claflin.finder.LeadingEigenvectorDriver
  • edu.claflin.finder.log.LogUtil
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.louvain_struct.LouvainAlgorithm
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.louvain_struct.LouvainAlgorithm.GroupData
  • edu.claflin.finder.LouvainDriver
  • edu.claflin.finder.Main
  • edu.claflin.finder.io.ManifestParser
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.girvan_newman_struct.MapBinaryHeap.ComparableComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.infomap_struct.MapEquation
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.leading_eigenvector_struct.Maths
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.leading_eigenvector_struct.Matrix (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.io.graph.NOABatchIO (implements edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphWriter)
  • edu.claflin.finder.logic.Node (implements java.lang.Comparable<T>)
    • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.infomap_struct.ModuleNode
  • edu.claflin.finder.algo.spanningtree.Prim.DistanceRecord
  • edu.claflin.finder.algo.spanningtree.Prim.DistanceRecordComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.infomap_struct.RelativeUndirectedBitLength
  • edu.claflin.finder.io.graph.SIFGraphIO (implements edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphReader, edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphWriter)
  • edu.claflin.finder.io.graph.SimpleGraphIO (implements edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphReader, edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphWriter)
  • edu.claflin.finder.SpanningTreeDriver
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.fast_greedy_struct.SparseMatrix
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.infomap_struct.Tester
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.leading_eigenvector_struct.Tester
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.louvain_struct.Tester
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.TreeNode<T> (implements java.lang.Comparable<T>)
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.TreeNodeInfo (implements java.lang.Comparable<T>)
    • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.fast_greedy_struct.TreeNodeInfoFG
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.infomap_struct.UndirectedTest
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.struct.fast_greedy_struct.VectorValue
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.Walktrap.MutualConnectionsRecord
  • edu.claflin.finder.WalktrapDriver

Interface Hierarchy

• edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CommunicationListener
• edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphReader
• edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphWriter
• edu.claflin.finder.logic.processor.Processable<T,S>

Enum Hierarchy

• java.lang.Object
  • java.lang.Enum<E> (implements java.lang.Comparable<T>, java.lang.constant.Constable, java.io.Serializable)
    • edu.claflin.finder.algo.Algorithm.GraphSortOrder
    • edu.claflin.finder.algo.ArgumentsBundle.COMMON_ARGS
    • edu.claflin.finder.log.LogLevel
    • edu.claflin.finder.log.LogType